Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg2aQ6P4T0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms