Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A8

Bckdhb, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhbQ6P3A8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BckdhbQ6P3A8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms