Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms