Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms