Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf6Q6NVF9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms