Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SphkapQ6NSW3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms