Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS69

Amer3, APC membrane recruitment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer3Q6NS69 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amer3Q6NS69 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amer3Q6NS69 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms