Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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