Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt77Q6IFZ6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms