Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw2Q6I6G8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms