Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edrf1Q6GQV7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms