Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Carmil1Q6EDY6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms