Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scaf8Q6DID3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms