Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep170Q6A065 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170Q6A065 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms