Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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Pdzrn3Q69ZS0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Pdzrn3Q69ZS0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Pdzrn3Q69ZS0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Pdzrn3Q69ZS0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Pdzrn3Q69ZS0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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Pdzrn3Q69ZS0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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