Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd6Q69ZL1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd6Q69ZL1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms