Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pkp4Q68FH0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pkp4Q68FH0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pkp4Q68FH0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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