Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp4fQ66X05 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4fQ66X05 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms