Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CilpQ66K08 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms