Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q66JV7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q66JV7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q66JV7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q66JV7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q66JV7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q66JV7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q66JV7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q66JV7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q66JV7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q66JV7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q66JV7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q66JV7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q66JV7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q66JV7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q66JV7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q66JV7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q66JV7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q66JV7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q66JV7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms