Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdc3Q64519 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdc3Q64519 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms