Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pan3Q640Q5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms