Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift52Q62559 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift52Q62559 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ift52Q62559 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift52Q62559 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift52Q62559 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift52Q62559 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift52Q62559 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift52Q62559 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift52Q62559 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms