Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lcn4Q62472 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lcn4Q62472 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lcn4Q62472 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lcn4Q62472 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lcn4Q62472 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn4Q62472 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn4Q62472 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn4Q62472 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lcn4Q62472 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms