Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sp4Q62445 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms