Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndrg1Q62433 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndrg1Q62433 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms