Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa13Q62424 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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