Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
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Ss18Q62280 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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