Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sall3Q62255 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms