Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm5dQ62240 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm5dQ62240 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms