Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npm1Q61937 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Npm1Q61937 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms