Protein–RNA interactions for Protein: Q61810

Ltbp3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp3Q61810 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ltbp3Q61810 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ltbp3Q61810 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ltbp3Q61810 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ltbp3Q61810 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ltbp3Q61810 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ltbp3Q61810 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ltbp3Q61810 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ltbp3Q61810 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ltbp3Q61810 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms