Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga7Q61738 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms