Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itm2aQ61500 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms