Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sox17Q61473 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sox17Q61473 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox17Q61473 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox17Q61473 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox17Q61473 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sox17Q61473 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sox17Q61473 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox17Q61473 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox17Q61473 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox17Q61473 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox17Q61473 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox17Q61473 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox17Q61473 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox17Q61473 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox17Q61473 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sox17Q61473 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sox17Q61473 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sox17Q61473 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sox17Q61473 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox17Q61473 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox17Q61473 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sox17Q61473 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sox17Q61473 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sox17Q61473 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sox17Q61473 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sox17Q61473 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox17Q61473 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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