Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp4Q60972 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms