Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik1Q60934 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms