Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurod1Q60867 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms