Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Caprin1Q60865 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms