Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnot7Q60809 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot7Q60809 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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