Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf3Q60803 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms