Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkn2cQ60772 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms