Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stxbp3Q60770 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms