Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms