Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms