Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SkilQ60665 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SkilQ60665 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms