Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CttnQ60598 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms