Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd5Q5VCS6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms