Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc11Q5U458 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc11Q5U458 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms