Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms